Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms