Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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