Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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