Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BTN2A2-201ENST00000352867 3241 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 C9orf84-202ENST00000374283 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZDHHC11B-202ENST00000508859 1631 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MCOLN3-203ENST00000370589 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZNF571-AS1-201ENST00000585578 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SCGB2A1-201ENST00000244930 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SAA2-201ENST00000256733 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL390786.1-201ENST00000432108 309 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MDC1-AS1-201ENST00000442150 738 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 OR2S1P-201ENST00000447226 950 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 C1QTNF9-AS1-201ENST00000449656 470 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 DMKN-219ENST00000461300 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 DMKN-239ENST00000474928 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 DMKN-253ENST00000488892 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC138356.2-201ENST00000521192 667 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 KRT18P47-201ENST00000561341 977 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC036222.1-201ENST00000579972 701 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC006115.3-201ENST00000594400 560 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL627309.8-201ENST00000595919 284 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC005906.2-214ENST00000640128 1235 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL035660.2-202ENST00000641233 242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC01140-206ENST00000484933 3368 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 VNN3-204ENST00000414302 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SSX2B-204ENST00000616191 1344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 CHRNA6-201ENST00000276410 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC037487.1-201ENST00000583416 2474 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 L3MBTL3-202ENST00000368136 4235 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 TMEM254-205ENST00000372281 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZBTB10-201ENST00000379091 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC004801.7-201ENST00000624535 2973 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ACSM5P1-201ENST00000566754 2438 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SLC44A2-202ENST00000407327 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 NPAP1P4-201ENST00000443325 3310 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 GRM7-204ENST00000402647 2034 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL033384.2-201ENST00000474641 456 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC093789.1-201ENST00000494861 649 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC01579-203ENST00000555023 400 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC027088.2-201ENST00000559870 916 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC008915.1-201ENST00000561624 837 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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