Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TMX3-204ENST00000562706 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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HOXA3O43365 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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