Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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SGF29Q96ES7 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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SGF29Q96ES7 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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SGF29Q96ES7 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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SGF29Q96ES7 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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SGF29Q96ES7 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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