Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTF1AQ7RTS3 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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