Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC115837.1-201ENST00000517662 1001 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SDK2Q58EX2 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms