Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms