Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
IMPG1Q17R60 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms