Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms