Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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