Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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