Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL592504.1-201ENST00000605319 439 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC02470-201ENST00000412084 979 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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