Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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