Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MAP3K19-202ENST00000375844 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SLFN12-202ENST00000394562 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MEF2C-239ENST00000636294 2576 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL627309.1-201ENST00000466430 2748 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PLA2G4A-201ENST00000367466 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 IBSP-201ENST00000226284 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 NOS2-201ENST00000313735 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC024610.2-203ENST00000636084 1348 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TGFB2-AS1-201ENST00000414452 557 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SCYL3-203ENST00000367772 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ASCC1-202ENST00000317168 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CCR3-201ENST00000357422 2000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TRIM43-201ENST00000272395 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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