Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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