Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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FOXF1Q12946 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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FOXF1Q12946 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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FOXF1Q12946 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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