Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms