Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
APCP25054 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APCP25054 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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APCP25054 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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APCP25054 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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APCP25054 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APCP25054 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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