Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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