Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms