Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAPAQ9P0L0 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
VAPAQ9P0L0 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms