Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AP000977.1-201ENST00000501964 2908 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TRPC7-206ENST00000513104 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CCDC129-201ENST00000319386 4544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ST6GALNAC5-202ENST00000477717 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DNM1P46-201ENST00000341853 3831 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 C11orf57-203ENST00000420986 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC02181-201ENST00000430050 4083 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01018-201ENST00000505626 3036 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BOLA2-SMG1P6-201ENST00000565417 3103 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEMA4A-202ENST00000368282 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RTEL1P1-201ENST00000504490 3685 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OR10Q1-201ENST00000316770 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 HIST1H2BPS1-201ENST00000369177 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL353779.2-201ENST00000424917 308 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MSMP-202ENST00000436428 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AP000695.2-202ENST00000454980 649 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC096637.1-201ENST00000458662 174 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TDGF1P3-201ENST00000493351 567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC091114.1-201ENST00000522815 630 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BORCS5-203ENST00000542728 580 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNASE12-201ENST00000556526 631 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC087699.1-201ENST00000558111 393 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC009139.1-201ENST00000561672 652 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RPL7AP66-201ENST00000588490 801 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms