Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms