Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms