Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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