Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HTR4Q13639 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HTR4Q13639 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HTR4Q13639 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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HTR4Q13639 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HTR4Q13639 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HTR4Q13639 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HTR4Q13639 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HTR4Q13639 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HTR4Q13639 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HTR4Q13639 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HTR4Q13639 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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