Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4BQ13620 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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