Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL022724.1-201ENST00000412132 554 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC116456.2-201ENST00000623018 2209 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KATNAL2-201ENST00000245121 2833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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