Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 XCR1-201ENST00000309285 5281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL160191.3-201ENST00000619152 2203 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL008729.1-203ENST00000606150 2305 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PDPN-201ENST00000294489 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 HCRTR2-201ENST00000370862 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SNX18P4-201ENST00000456554 838 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP000911.4-201ENST00000532272 516 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC113349.2-201ENST00000607804 377 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 THBS4-204ENST00000511733 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 USP46-207ENST00000508499 1419 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ADAMTS9-AS1-206ENST00000493124 1511 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 EFHC1-226ENST00000636954 2129 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MSS51-201ENST00000299432 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RGS4-204ENST00000421743 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OR1F1-201ENST00000304646 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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