Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 XDH-201ENST00000379416 5688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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