Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GABPAQ06546 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GABPAQ06546 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GABPAQ06546 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GABPAQ06546 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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