Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms