Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD13P35453 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD13P35453 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD13P35453 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD13P35453 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD13P35453 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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