Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRRIQ1Q96JM4 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms