Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ARRDC4Q8NCT1 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ARRDC4Q8NCT1 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms