Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTF1AQ7RTS3 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms