Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SDK2Q58EX2 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms