Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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