Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms