Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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