Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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CUL3Q13618 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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CUL3Q13618 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CUL3Q13618 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CUL3Q13618 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CUL3Q13618 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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