Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
DUSP4Q13115 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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