Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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TRAF1Q13077 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRAF1Q13077 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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