Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MCAMP43121 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MCAMP43121 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MCAMP43121 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCAMP43121 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCAMP43121 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCAMP43121 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms