Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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