Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009228.1-203ENST00000430105 432 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HIPK1-AS1-203ENST00000441071 571 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP101-201ENST00000517036 108 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PHACTR1-205ENST00000379350 4784 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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