Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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