Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms